在最简单的生物体中，有许多动物和人类的寄生虫。下面列出了引起最严重和常见疾病的寄生原生动物。
痢疾阿米巴原虫
痢疾阿米巴与普通阿米巴相似，但体型较小，根柄较短且较宽。它在囊肿阶段通过口腔进入人体消化系统。在大肠中，阿米巴原虫从包囊中出现并以细菌为食，而不会伤害人体。随后，这种简单的生物体开始穿透肠壁，以红细胞为食，并成为寄生虫。肠道内形成溃疡，消耗人体能量。发生阿米巴痢疾或阿米巴病。
痢疾阿米巴原虫可以进入血液并到达肝脏。在这里，寄生虫也会导致化脓性溃疡的形成。
变形虫形成包囊，将未消化的食物残渣留在人体。轻的囊肿很容易扩散。如果不洗手和食物，您可能会被感染。
疟疾疟原虫
疟原虫是一种寄生原生动物。某些疟原虫种类会引起人类疟疾。疟原虫的携带者是疟蚊。在昆虫叮咬期间，疟原虫进入宿主的血液。它与血液一起到达肝脏，在那里进食、生长和繁殖。此后，许多疟原虫再次进入血液并开始寄生红细胞，破坏它们并释放其废物，从而毒害宿主。一个人发烧并患有贫血。
如果疟疾患者再次被疟蚊叮咬，疟原虫就会从该人转移到蚊子身上。疟原虫在蚊子体内进行有性繁殖。
疟疾在非洲很常见。这是一种非常危险的疾病。除其他外，通过消灭携带疟疾的蚊子来对抗疟疾。
锥虫
锥虫属由具有鞭毛的寄生原生动物组成（与眼虫关系密切）。它们的主要宿主是脊椎动物，其携带者通常是昆虫。锥虫的不同代表在动物和人类中引起不同的疾病。它们主要寄生在血液和脑脊液中。由锥虫引起的最著名和最常见的疾病是昏睡病。
昏睡病的传播媒介是采采蝇。这种疾病是热带非洲的典型疾病。昏睡病的发展分为两个阶段：最初几周，患者会受到发烧和疼痛的折磨，一个月或更长时间后，会出现困倦、睡眠和协调性障碍以及意识改变。这种疾病在第一阶段比较容易治疗。
贾第鞭毛虫
贾第鞭毛虫是一种有鞭毛的寄生原生动物。肠道蓝氏菌会导致人类和动物贾第鞭毛虫病，寄生虫生活在小肠中。
一个人通过食用含有贾第虫包囊的未清洗食物而感染贾第虫病。从包囊中出来后，兰伯利亚将自己附着在肠道上并以消化的食物为食。
利什曼原虫
利什曼原虫是寄生原生动物的另一个属。它们会引起人类和许多其他动物的利什曼病。传播者是蚊子。
有不同类型的利什曼病与身体各种组织的损伤有关。其中之一是皮肤病彭登斯基溃疡。
球虫属
球虫寄生于许多动物，包括蠕虫、节肢动物和鱼类。它们引起球虫病，对畜牧业和养鱼业造成严重损害。
球虫以含有寄生虫细胞的孢子形式定居。
球虫包括弓形虫属。它们的代表在人类中引起一种广泛传播的疾病，如弓形虫病。一个人会因宠物或准备不当的肉类食品而受到感染。弓形虫影响许多器官，包括神经系统。